年终奖如已并入工资薪金所得中申报，个税APP就不能改成年终奖单独计算了，可通过扣缴单位更正申报进行处理。
具体操作如下步骤一：启动更正（1）进入扣缴端，选择需要更正的“税款所属月份”。
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（2）点击【综合所得申报】进入综合所得申报界面，点击【4申报表报送】查看当前月份申报状态，只有申报状态为“申报成功”的情况下才允许启动更正申报。
（3）点击【更正申报】按钮，启动更正申报，系统提示往期错误更正申报成功后，需要对后续税款所属期的综合所得预扣预缴申报表进行逐月更正。
启动往期更正（后面税款所属期存在申报成功记录）时，系统会自动导出一份当前有效的申报记录供纳税人留存备用并提示保存路径（默认为桌面），每次导出的备份文件可根据时间不同进行区分。如果需要取消/启用本功能，可以在【系统设置】-【申报管理】-【更正申报备份】中设置。但因取消而导致无法找回原始记录的，扣缴单位需自行承担后果。
步骤二：报表填写点击【1收入及减除填写】，系统提示往期错误更正，不能新增人员和修改累计专项附加扣除额。选择需要修改的所得项目。需要更正的人员，双击相应数据进入编辑界面修正错误数据。（累计专项附加扣除额不允许修改，如需修改，需前往办税服务厅）；需要删除的人员，勾选相应数据后删除。步骤三：税款计算完成申报表本期数据的更正后，点击【2税款计算】，重新计算更正后的应补（退）税额。
步骤四：附表填写【1收入及减除填写】中如果填写了“减免税额”、“商业健康保险”或“税延养老保险”，需要在【3附表填写】中完善附表信息。
步骤五：申报表报送和税款缴纳报表填写完成后，可按照正常申报流程通过【4申报表报送】功能进行报送。报送成功后，如果有新的应征信息产生时，可通过【税款缴纳】菜单完成税款的缴纳。若报送时提示报送不成功的，应按提示信息修改后重新报送或到办税服务厅处理。步骤六：
撤销更正如果在报送申报表之前，发现原申报数据无误，可点击【撤销更正】按钮，撤销更正申报。但成功报送申报表后，则无法撤销更正。如需要使用原申报数据，可查看系统自动导出备份的原申报记录。注意事项：01扣缴客户端不支持税款所属期在2019年8月（含8月）之前的预扣预缴更正。
02在办税服务厅更正后，扣缴端原有申报数据不会更新，请在【系统设置】-【申报管理】-【综合所得算税】中设定为“在线算税”，以保障以后月份申报时的累计数据能按更正申报后的最新数据计算。
03更正申报往期月份时，后期月份应该逐月进行更正，如未逐月更正，将导致以后月份申报时不能获取正确累计数据。
04若更正申报后需要办理退（抵）税的，由扣缴单位前往办税服务厅申请办理误收退（抵）税业务。
05若更正月份已在办税服务厅更正过的，或扣缴端没有历史申报数据的，需前往办税服务厅更正。
06如果员工已办理所属年度综合所得汇算清缴，则该年度所涉及月份更正申报只能到柜台办理更正。
07扣缴客户端支持扣缴单位对所有员工进行全量更正，也支持仅对有错误的员工进行个别更正。
08在更正申报时，向更正申报所属期存在异议申诉属实的员工发送更正核实信息，需要员工确认后方可更正。
来源：厦门税务、小陈税务08